Sake doet een jaar lang vrijwilligerswerk in een botanische tuin. Hij is heel erg geïnteresseerd in alles wat groeit en bloeit. Net als hij denk een heel geschikte vrijwilligersklus gevonden te hebben, gebeurt er iets dat hem en alle medewerkers van de botanische tuin onrustig en argwanend maakt. Er worden planten gestolen, heel bijzondere. De dief weet blijkbaar precies wat hij doet en dat maakt alle medewerkers van de tuin verdacht, ook Sake. Het laat hem niet los. Terwijl hij steeds meer over exotische plantensoorten te weten komt, komt hij ook steeds dichter bij de oplossing van het geheim van deze tuin. Het geheim van de botanische tuin is een spannend boek dat een beroep doet op de speurzin van de lezer en dat tevens op onderhoudende wijze informatie geeft over botanische tuinen.